打噴嚏、舌痛的原因較多，可能是由於非疾病因素導致，也可能是由於過敏性咽炎、感冒、外傷等疾病因素引起。如果症狀持續不緩解或伴有其他不適表現時，建議及時就醫檢查。
非疾病因素
若在打噴嚏過程中過於用力或是次數過多，則可能會使舌頭受到外界刺激而出現疼痛的症狀，一般屬於正常現象，在停止打噴嚏後可逐漸恢復。
疾病因素
過敏性鼻炎
患者接觸了過敏原如花粉、動物皮毛等物質，會誘發身體產生相應的抗體，致使肥大細胞活化並釋放組胺類的生物活性介質，會對鼻腔黏膜造成較強的刺激，繼而會出現打噴嚏的表現，並且還會伴隨鼻塞、流涕等症狀。當鼻腔內的液體倒流入到口腔內時，就會對咽喉部以及舌根部位造成一定的刺激，從而引發疼痛感。此時應及時遠離過敏原，並遵醫囑使用氯雷他定(Loratadine)、勝克敏（Cetirizine）等藥物進行抗過敏治療。
感冒
主要是由流感病毒、副流感病毒等因素所引起的上呼吸道感染性疾病，病原體侵入人體之後，會導致體溫調節中樞功能障礙，致使患者出現發燒的情況，同時還會刺激鼻腔和喉嚨部位，進而會引起打噴嚏以及疼痛的現象發生。若未得到及時有效的處理，還可能會影響到正常的食慾，甚至會影響營養吸收，不利於疾病的恢復。此時可在醫生指導下服用複合氨酚烷胺顆粒、連花清瘟膠囊等藥物進行治療。
外傷
若舌頭被牙齒或其他硬物刮碰到了，就容易傷害區域性組織而出現腫脹、充血等情況，而且也會有明顯的觸痛或者紅腫等現象。若在此期間仍頻繁用該側牙齒咀嚼食物，則會使患處受到反覆刺激，從而加重上述不適症狀。通常可用冰袋對區域性進行冷敷來減輕滲出，若已經出現了膿腫，則需要透過切開引流的方法進行治療。
此外，扁桃腺炎、皰疹性口炎等也可引起此情況。日常生活中要注意做好保暖措施，避免受涼，同時還應適當增加飲水量，有助於促進病情恢復。
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