導致兒童出現夜間咳嗽的原因較多，如上呼吸道感染、過敏性鼻炎、氣喘等。如果症狀較輕，一般不需要吃藥治療，但如果症狀較為嚴重，則需要在醫生指導下使用藥物進行對因或對症治療。
對因治療
上呼吸道感染
若由於細菌感染引起，可遵醫囑服用希復欣敏(Cefixime)顆粒、阿莫西林（Amoxicillin）等抗生素類藥物進行抗感染治療；如果是病毒感染所致，通常具有自限性，一段時間後可自行恢復，無需特殊處理，必要時也可在醫生的指導下應用克流感(Oseltamivir)等抗病毒藥物進行治療。
過敏性鼻炎
通常是接觸了花粉、塵蟎等易致敏物質所引發，會出現打噴嚏、流涕等症狀，並且會伴隨晚上睡覺時陣發性的咳嗽。此時應避免再次接觸上述物質，還可遵醫囑服用氯雷他定(Loratadine)、鹽酸左卡巴斯汀口服溶液等抗組織胺藥物進行治療。
氣喘
可能是遺傳因素以及環境因素共同作用的結果，會導致患者出現喘息、氣急、胸悶等症狀，在吸入刺激性氣味或者接觸到某些物品之後，可能會使病情發作，也會伴有夜間咳嗽的症狀。建議及時帶孩子到醫院就診，完善相關檢查並積極配合醫生進行針對性治療，常用藥物包括布地奈德（Budesonide）吸入氣霧劑、撲咳喘(Bricanyl)等。
胃食道逆流
可能與飲食不當有關，患病以後容易導致食物倒流入咽喉部，會對區域性造成一定的刺激，從而誘發咳嗽的情況發生。可以在醫生的指導下服用促進胃動力的藥物進行治療，比如多普利杜(Domperidone)混懸液、摩舒胃清(Mosapride)等。
對症治療
對於存在痰液阻塞情況引起的夜間咳嗽，可以遵醫囑服用化痰止咳的藥物進行治療，例如安嗽錠(Ambroxol)、小兒肺熱咳喘口服液等。
其他方法
平時應注意適當增加飲水量，有助於稀釋痰液而緩解咳嗽症狀。
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