臨床上治療甲亢導致的心跳過快即心律不整的藥物較多，可分為抗甲狀腺類、β感受器阻滯劑以及改善症狀類等。建議患者在醫生指導下選擇合適的藥物進行針對性治療。
抗甲狀腺類
咪唑類
常用僕樂彼錠(Propylthiouracil)和甲硫嗎唑錠(Methimazole)兩種，透過抑制甲狀腺內過氧化物酶，使碘化酪氨酸耦聯障礙，從而減少甲狀腺素的合成。用藥期間需注意監測血常規及肝功能變化，並定期複查甲狀腺功能。
硫脲類
常用藥物為雙碘酸鉀、癲能停(Phenytoin)、氯喹等，可抑制甲狀腺內的過氧化物酶，阻礙酪氨酸變成碘化酪氨酸，同時還能促使已形成的碘化酪氨酸轉變成無機碘，而被排出到細胞之外，以達到阻止或中斷甲狀腺素形成的目的。但服用此類藥物可能會出現白血球下降的情況，因此需要定期檢查血象。
β感受器阻滯劑
主要有舒壓寧(Metoprolol)、康肯膜衣錠(Bisoprolol)等，能夠減慢房性期縮短型心率過快，也可用於室上性期縮短型心率過快。這類藥物具有降低心肌耗氧量、穩定冠狀動脈斑塊的作用，在服藥後一般不會引起心跳過慢，也不會影響患者的血脂代謝情況。
改善症狀類
當甲亢合併快速心律不整時，如陣發性心房顫動、心房撲動伴有預激症候群等情況，通常不首選抗甲狀腺類藥物，以免誘發或加重心率過快的症狀。此時可以使用心律錠(Propranolol)等藥物控制心率，也可以加用胺碘酮來預防心律不整復發。
其他
部分中藥對甲亢也有一定的療效，比如夏枯草膠囊、丙硫氧噻吩片等，但是具體效果因人而異。另外，對於病情嚴重的患者，可能還需要採取手術切除部分甲狀腺組織的方法進行治療。
由於甲亢屬於內分泌疾病，所以日常生活中還需遵醫囑規範應用促甲狀腺素釋放賀爾蒙、左甲狀腺素鈉(Levothyroxine)等藥物聯合治療，以維持身體正常的生理狀態。此外，還要避免進食含碘高的食物，如海帶、紫菜等。
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