臨床常用治療肺結核的藥物包括抗結核一線藥物、抗結核二線藥物以及抗結核三線藥物。如果患者確診為肺結核後，在醫生指導下進行針對性用藥治療即可。
抗結核一線藥物
1.利福平(Rifampin)：屬於一種廣譜殺菌劑，可以抑制細菌RNA的合成，阻斷轉錄與翻譯過程，從而起到抑菌和殺菌作用，可用於多種結核病的初治病例。
2.異煙肼(Isoniazid)：具有抑制DNA、RNA及蛋白質合成的作用，可使細胞內代謝處於混亂狀態而死亡。常用於各型結核病的治療，尤其對各型結核病療效較肯定。
吡嗪醯胺
該藥主要透過干擾蛋白酶系統，阻礙菌體蛋白合成，從而使細菌無法生長繁殖。常與其他抗結核藥聯合應用治療肺結核，如與其他4種抗結核藥聯合使用效果較好。
乙胺丁醇
是一種常用的抗結核藥，可透過抑制葡萄糖攝取和運轉，減少葡萄糖酵解，並能抑制葡萄糖基轉移酶，阻止細菌以葡萄糖作為能源。此外，還可以抑制依賴於ATP的蛋白質合成，最終導致細菌死亡。
5.鏈黴素(Streptomycin)：是目前臨床上唯一有效的氨基糖苷類抗生素，其抗菌機制是抑制細菌蛋白質的合成，但不干擾正常人體組織的蛋白質合成。常用於各型結核病的治療，尤其是急性血行播散性肺結核和兒童肺結核患者的治療。
抗結核二線藥物
1.左氧氟沙星（Levofloxacin）：屬於喹諾酮類抗菌藥，透過抑制細菌DNA旋轉酶的活性而起殺菌作用，對各種革蘭陰性桿菌和革蘭陽性球菌有效。
莫西沙星
也屬於喹諾酮類抗菌藥，透過抑制細菌RNA的合成而發揮抗菌作用，對綠膿桿菌等假單胞菌屬細菌敏感。
抗結核三線藥物
當患者出現嚴重的肺結核且對上述抗結核藥物過敏時，可在專業醫師指導下服用愛黴素(Amikacin)、賽普沙辛(Ciprofloxacin)等其他氨基糖苷類藥物或頭孢曲松(Ceftriaxone)等其他頭孢類藥物進行治療。
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