若感染腺病毒的寶寶病情較輕，一般不會出現後遺症。但如果寶寶病情較為嚴重，則可能會出現神經系統傷害、心肺功能異常等後遺症。
若感染腺病毒的寶寶病情較輕，一般不會出現後遺症。但如果寶寶病情較為嚴重，則可能會出現神經系統傷害、心肺功能異常等後遺症。
神經系統傷害
由於病毒感染可導致神經元細胞變性或壞死，故部分寶寶可能出現反應遲鈍、智力障礙等情況。此外，還可能伴有共濟失調、眼球運動障礙等症狀。
心肺功能異常
當腺病毒侵犯心肌組織時，可能導致寶寶出現心律不整、心臟擴大等病變；而如果侵襲到支氣管黏膜，則有可能引起呼吸道發炎，甚至造成呼吸困難的情況發生。另外，還有可能對肝臟和腎臟的功能產生影響，從而誘發肝炎、腎炎等疾病。
其他情況
除上述常見症狀外，部分寶寶還可表現為關節畸形、眼底視網膜受損以及耳聾等併發症。
臨床上對於此類寶寶通常採取綜合治療措施，如臥床休息、補充水分與營養物質，並遵醫囑應用雷巴威林(Ribavirin)顆粒、注射用阿糖腺苷等抗病毒藥物進行治療。必要時還需透過吸氧等方式改善缺氧狀態，以促進身體恢復。
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