對於兒童急性中耳炎的治療，主要透過藥物進行抗感染、止痛等對症處理。如果病情較重或反覆發作，則需要靜脈吊點滴治療。在用藥前一定要明確病因和疾病型別，在醫生指導下合理使用抗生素類藥物、類固醇以及非類固醇抗發炎藥解熱止痛劑。
區域性滴鼻劑
當患有急性上呼吸道感染時，發炎可經咽鼓管逆行進入中耳引發急性中耳炎。此時可以給兒童應用Ephedrine/Nitrofurazone鼻滴液減輕鼻黏膜充血水腫的情況，緩解咽鼓管阻塞的現象，從而減輕耳朵悶脹感。
抗生素類藥物
盤尼西林類
如阿莫西林+克拉維酸鉀(Amoxicillin+Clavulanate)、阿莫西林（Amoxicillin）等，具有廣譜抗菌作用，是目前常用的治療兒童急性中耳炎的藥物之一。
2.頭孢菌素(Cephalosporins)類：如小兒希復欣敏(Cefixime)顆粒、頭孢丙烯(Cefprozil)幹混懸劑等，適用於對抗生素耐藥菌所致的嚴重感染，尤其支原體肺炎合併急性化膿性中耳炎效果較好。
大環內酯類
如紅黴素(Erythromycin)片、紅黴素(Erythromycin)等，可用於治療鏈球菌屬、葡萄球菌等革蘭陽性細菌引起的急性中耳炎。
喹諾酮類
如氧氟沙星(Ofloxacin)滴耳液、左氧氟沙星(Levofloxacin)等，此類藥物抗菌譜廣，穿透力強，殺菌作用迅速，但因其有潛在毒性，故不建議用於18歲以下人群。
類固醇
若兒童伴有過敏症狀，可在醫生指導下適當應用地塞松(Dexamethasone)、普賴鬆(Prednisone)等藥物進行霧化吸入治療，以達到快速消腫的目的。
四、非類固醇抗發炎藥解熱止痛劑
部分兒童患急性中耳炎後會出現較為明顯的疼痛症狀，可以在醫生指導下口服布洛芬（Ibuprofen）、乙醯胺酚（Acetaminophen）緩釋片等非類固醇抗發炎藥退燒藥物幫助改善不適症狀。
此外，中醫角度認為，針對於風寒感冒所導致的急性中耳炎，還可遵醫囑服用正柴胡飲顆粒、外感風寒顆粒等疏風散寒的中成藥製劑輔助治療。
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