抗憂鬱藥物的不良反應主要包括胃腸道不適、神經系統症狀以及心血管系統等其他系統的症狀。由於個體差異較大，服用不同種類的抗憂鬱藥物出現的不良反應也有所不同。
胃腸道不適
噁心
幾乎所有型別的抗憂鬱藥物都可能引起不同程度的噁心，但左洛復、曲唑酮和彌鬱停(Mirtazapine)引起的噁心程度較輕，千憂解(Duloxetine)則很少引起噁心。
嘔吐
與噁心類似，幾乎所有的抗憂鬱藥物均可導致嘔吐的發生，其中舍曲林(Sertraline)發生率最低，而艾司西酞普蘭則相對較多見。
腹瀉
臨床研究顯示，文拉法辛(Venlafaxine)可促進結腸蠕動並改善糞便性狀，從而減輕便秘的症狀。
便秘
臨床研究表明，5-羥色胺再攝取抑制劑類抗憂鬱藥如氟伏沙明、舍曲林(Sertraline)、西酞普蘭及帕羅西汀（Paroxetine）均能有效緩解患者的便秘症狀；SSRI類中的氟西汀(Fluoxetine)對便秘的影響不明顯，而穩舒眠(Chlorpromazine)則可能會加重便秘。
神經系統症狀
鎮靜作用增強
臨床上使用較為廣泛的三環類抗憂鬱藥物(如德利能(Amitriptyline))可顯著增加患者昏睡時間，降低警覺水平，並且可能導致宿醉樣現象。
頭暈/眩暈
臨床試驗表明，選擇性正腎上腺素再攝取抑制劑千憂解(Duloxetine)可使患者更容易出現頭暈或眩暈的感覺，提示該藥具有一定的前庭神經刺激作用。
運動障礙
臨床研究發現，思樂康(Quetiapine)、奥氮平(Olanzapine)、理思必妥(Risperidone)、氨磺必利(Amisulpride)、阿立哌唑等抗精神疾病藥物可用於治療難治性憂鬱發作時，不會產生錐體外系統症候群的風險。
心血管系統症狀
臨床試驗結果顯示，臨床常用的抗憂鬱藥物中，千憂解(Duloxetine)、艾司西酞普蘭、文拉法辛(Venlafaxine)、西酞普蘭、伏硫西汀、穩舒眠(Chlorpromazine)、舒美寧(Mirtazapine)等均有升高血壓的作用，而立定(Lithium Carbonate)、帝拔癲(Valproate)、卡麥角林(Cabergoline)等有降壓的效果。
其他症狀
部分抗憂鬱藥物還可影響認知功能，如干擾記憶再現過程，延長短時記憶保持的時間，從而造成健忘的現象。此外，臨床還可見到嗜睡、失眠、體重改變、視覺幻覺、尿瀦留等症狀。
若服藥期間出現上述不良反應，建議及時就醫進行相關檢查，在醫生指導下更換其他藥物繼續治療或調整當前用藥方案，以免延誤病情。
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