臨床上常用的抗憂鬱藥較多，不同種類、劑型以及作用機制的抗憂鬱藥所引起的不良反應也各不相同。總體而言，抗憂鬱藥常見的不良反應包括心血管系統症狀、神經系統症狀、消化道症狀等。
心血管系統症狀
心跳過快
如阿米替林、可洛米普明(Clomipramine)等，這類藥物可引起輕度至中度的加快的心跳過快，在治療初期較易發生，尤其是老年患者及嚴重心血管疾病的患者更易出現。
姿勢性低血壓
部分抗憂鬱藥能抑制血管收縮和自主神經功能，導致姿勢性低血壓，常見於選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑類藥物，如舍曲林(Sertraline)、無鬱寧(Fluvoxamine Maleate)等。
其他情況
如丙米嗪、西酞普蘭等，可能會引起心律不整、房室傳導阻滯或陣發性夜間呼吸暫停症候群加重等情況。
神經系統症狀
頭暈
如艾司西酞普蘭、利普能(Escitalopram)等，此類藥物在使用早期可能出現頭暈不適感，隨著用藥時間延長而逐漸減輕。
思維異常
如文拉法辛(Venlafaxine)緩釋膠囊、酒石酸唑吡坦片等，可能影響患者的注意力、記憶力、空間位置判斷能力等認知功能，少數人表現為思維混亂、敏感多疑、焦慮不安等症狀。
消化系統症狀
噁心嘔吐
如鹽酸馬普替林(Maprotiline HCL)、氨磺必利(Amisulpride)等，服用後可能導致胃腸道蠕動減慢，引發噁心、嘔吐的症狀。
其它症狀
水腫
如氫溴酸西酞普蘭(Citalopram)片、阿戈美拉汀(Agomelatine)等，長期服藥者可能出現顏面部水腫的情況。
體重增加
如威克倦(Bupropion)、奥氮平(Olanzapine)口崩片等，由於這些藥物具有中樞興奮的作用，可能導致食慾下降，從而造成體重減輕；但也有少部分人會出現相反的情況，即體重增加。
光過敏
如思樂康(Quetiapine)、氨磺必利(Amisulpride)等，長時間服用上述藥物的人群如果受到陽光暴曬，則可能發生日光性皮炎。
高血糖
如鹽酸託莫西汀膠囊、阿戈美拉汀(Agomelatine)等，部分人群服用以上藥物期間可能出現血糖升高的情況。
此外，臨床常用的一些中藥也可能含有一定量的鎮靜催眠成分，如複合煩靜錠(Diazepam)、穀維素等，因此建議正在接受治療的憂鬱症患者避免飲酒，以免加重病情。同時也要注意適當休息，保證充足的睡眠，有助於疾病恢復。
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