導致兒童出現反覆發燒、咳嗽的原因較多，可能是非感染性因素所致，也有可能是呼吸道感染性疾病、肺部感染性疾病等感染性因素引起。如果症狀長時間未見緩解，則建議及時就醫，在醫生指導下進行治療。
一、非感染性因素
由於環境溫度過高或過低，以及穿衣過多，可刺激身體產生免疫反應，從而出現反覆發燒的情況，並且還會伴有咳嗽的症狀。一般不需要特殊處理，適當調整室內溫溼度，注意保暖即可。
二、感染性因素
呼吸道感染性疾病
如過敏性氣喘、喘息性支氣管炎、慢性阻塞性肺疾病、急性咽炎、扁桃腺炎、百日咳等，均可刺激身體發生過敏反應，出現反覆發燒、咳嗽的現象。此時需要在醫生的指導下使用布洛芬（Ibuprofen）、對乙醯氨基酚口服溶液等藥物降溫，並使用阿莫西林（Amoxicillin）、希復欣敏(Cefixime)顆粒等抗生素類藥物抗感染治療。
肺部感染性疾病
常見於肺炎鏈球菌肺炎、病毒性肺炎、衣原體肺炎、真菌性肺炎等，發炎因子會刺激體溫中樞，導致反覆發燒的情況，還可因發炎刺激而使分泌物增多，進而出現咳嗽現象。對此需遵醫囑應用青黴素G(Penicillin G)、利巴韋林(Ribavirin)等藥物進行消炎抗菌治療。
其他方面
如川崎病、風溼熱、系統性紅斑狼瘡等也可影響體溫調節中樞而導致反覆發燒、咳嗽。另外，當胃腸道受到細菌或病毒侵襲時，也會釋放內源性發燒物質作用於體溫調節中樞，使其功能紊亂而引起反覆發燒、咳嗽等症狀。此時可在醫生的指導下服用舒腹達（Diosmectite）、雙歧杆菌三聯活菌散等止瀉藥及益生菌類製劑改善腹瀉情況，同時還需針對病因給予相應藥物治療，如上呼吸道感染者可使用安嗽錠(Ambroxol)、氫溴酸鹽右美沙芬(Dextromethorphan HBr)等鎮咳化痰類藥物幫助恢復健康。
日常生活中，家長應避免給兒童穿太多衣服，以免出汗後受涼而加重不適。同時還要做好個人防護措施，盡量少帶兒童到人流量密集的地方，外出時佩戴好口罩。
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