如果患者存在牙周病，並伴有頭痛的症狀，需要根據病因進行治療。如果是由於精神緊張、睡眠不足等非疾病因素導致的頭痛，則不需要特殊處理。但如果是由牙齒病變引起的頭痛，則可以進行藥物治療或手術治療。
一、非疾病因素
可能是由於精神緊張、壓力過大以及長期熬夜等原因造成的頭痛症狀，此時與牙周病無關。建議放鬆心情，避免過度勞累，保證充足的休息時間，通常可緩解不適症狀。
二、疾病因素
抗炎止痛劑
如布洛芬（Ibuprofen）、雙氯芬酸鈉(Diclofenac sodium)等，能夠抑制環氧化酶活性，從而減少前列腺素生成，發揮鎮痛和抗炎的作用，但無法徹底消除牙周病所引起的基礎病變。
抗菌消炎藥
主要包括阿莫西林（Amoxicillin）、甲硝唑(Metronidazole)等抗生素類藥物，也可以使用紅黴素(Erythromycin)、頭孢呋辛酯(Cefuroxime Axetil)顆粒等廣譜抗生素類藥物。此類藥物具有較強的抑菌作用，可以起到殺滅細菌的效果，幫助病情恢復。
止痛藥
若疼痛較為劇烈且持續不退時，可在醫生指導下服用乙醯胺酚（Acetaminophen）片、複合舒痛停(Tramadol)等藥物以減輕患者的痛苦。
根面平整術
適用於釉質移位而造成咬合創傷者，目的是將遊離端移到正常位置，使患處軟組織得到保護後自行修復。
潔治刮治術
即齦上潔治術和齦下刮治術，其中齦上潔治術利用超聲波洗牙器發出的高頻震盪頻率，去除附著於牙頸部及齦緣附近的菌斑、結石；齦下刮治術是用探針在牙周囊袋內來回刮動，達到清除牙垢的目的。透過定期進行上述操作，控制菌斑堆積並促進新組織形成。
牙冠延長術
適用於因頜骨萎縮而出現遊離端牙槽骨過短的情況，一般採用截骨技術向遠中移動遊離端牙槽嵴，使牙根獲得長度補償，防止患牙鬆動或脫落。
正畸治療
對於個別牙錯位影響咀嚼功能者，可透過矯正的方式進行改善，如戴活動矯治器、固定矯治器或者隱形矯治器等。
其他方法
當區域性已形成囊腫或膿腫時，還需及時切開引流，以免延誤病情。同時還要注意保持口腔衛生，養成良好的刷牙習慣，飯後勤漱口，有助於延緩疾病的進展。
以上措施僅能暫時緩解患者不適感，若想從根本上解決問題，還需要積極就醫採取針對性治療。日常生活中也應做好護理工作，以防繼發感染。
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