如果在進行影像學檢查時發現患者存在腎臟泥沙樣的結石，通常提示結石比較小。此時可以先透過多飲水、適當運動等一般治療措施促進結石自行排出，並且要定期複查超音波以明確具體情況。若經保守治療後無效，則可能需要考慮進行體外衝擊波碎石或手術治療。
一、一般治療
多飲水
當被診斷為腎結石以後，患者應增加每天的飲水量至3000mL以上，使每日產生的代謝產物和尿路中的細菌、結石等物質充分得到稀釋，防止形成結晶而誘發或者加重病情。
適當運動
對於部分較小的腎結石，在日常生活中還應該鼓勵患者積極進行運動，如慢跑、跳繩等，能夠有效促使結石向輸尿管下端移動，甚至隨著尿液一起排入膀胱中再由尿道排出。
二、藥物干預
由於感染引起的腎結石，可以在醫生指導下使用抗生素類藥物控制發炎反應，常用的有阿莫西林（Amoxicillin）、希復欣敏(Cefixime)分散片等。而對於疼痛症狀明顯的患者，還可以應用布洛芬（Ibuprofen）、雙氯芬酸鈉(Diclofenac sodium)等非類固醇抗發炎藥予以緩解。
三、體外衝擊波碎石
主要利用高能量衝擊波對準腎結石聚焦，使其發生機械粉碎作用，從而幫助其排出。但是僅適合於直徑小於2cm的腎結石，而且結石距離腎臟切面大於1cm的情況下。此外，對於腎盞部位的結石效果不佳，還需要配合其他方法共同處理。
四、內鏡取石術
包括經皮腎鏡碎石術、輸尿管軟鏡碎石取石術以及腹腔鏡取石術等。其中經皮腎鏡碎石術適用於積水型腎結石，特別是位於腎臟上極的大結石。而輸尿管軟鏡碎石取石術則更適合於鹿角狀結石及累及整個腎臟的多個鑄型結石。另外，對於合併重度腎功能不全者，也可以選擇腹腔鏡取石術的方式將結石去除。
五、外科手術
比如開放性腎切除術，主要針對的是孤立腎的結石長期不能夠排除，或者是反覆發作的單側結石伴有嚴重腎功能損害的情況。除此以外，也可根據自身情況選擇輸尿管全長切除術、腎竇切開取石術等方式進行治療。
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