腦積水、脊柱裂的病因較為複雜，可能是遺傳因素導致，也有可能是胚胎時期發育異常引起。另外與母親妊娠期間受到病毒感染、藥物影響等也有一定關係。
腦積水、脊柱裂的病因較為複雜，可能是遺傳因素導致，也有可能是胚胎時期發育異常引起。另外與母親妊娠期間受到病毒感染、藥物影響等也有一定關係。
遺傳因素
如果家族中有人患有腦積水或者脊柱裂的情況，則後代出現上述疾病的機率會增加。
胚胎時期發育異常
環境因素
在懷孕早期時，如果孕婦經常接觸農藥以及化學物品等有毒有害物質，可能會對胎兒造成一定的傷害，從而誘發脊柱裂以及腦積水的發生。
營養不良
由於母體缺鈣或葉酸不足等原因，可使神經管閉合不全而發生缺陷，進而引發脊柱裂和腦積水。
感染
若女性在懷孕初期受到風疹病毒、流行性感冒病毒及克沙奇病毒等各種病原微生物感染，可能導致胎兒畸形，如出現腦室系統擴張等情況，最終形成腦積水，還可能伴有脊髓缺損、截癱等症狀。
其他原因
如果男性生殖器官受到病毒感染，比如梅毒螺旋體、單純皰疹病毒等侵襲，且沒有及時治療，此時進行無保護措施的性生活，可導致其基因突變，從而影響到精子品質，若在此受精後，會導致胚胎出現染色體異常，進而表現為腦積水、脊柱裂。
此外，還可能與父母雙方有先天性脊柱裂、腦積水的基因有關，在經過父系或母系傳遞後，就會出現子代患該病的機率增加。當患者被診斷為腦積水、脊柱裂時，建議前往醫院神經外科就診，完善相關檢查明確具體病因，並積極配合醫生進行針對性處理。
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