尿毒症患者進行血液透析時，通常需要使用血管活性藥物、鈣劑、鐵劑、β2感受器激動劑等針對病因的藥物。此外，還需要應用抗感染類、非類固醇抗發炎藥（NSAID）、降壓藥、利尿藥等針對症狀的藥物。
針對病因的藥物
血管活性藥物
如重組人腦鈉尿肽，可擴張患者的腎小球出球動脈和入球動脈，使有效濾過面積增大，從而提高腎臟清除代謝產物及調節水電解質平衡的作用。
鈣劑
由於長期低白蛋白血症以及應用利尿劑等原因，容易導致患者出現繼發性副甲狀腺功能亢進的情況，此時可以遵醫囑口服碳酸鈣(Calcium carbonate)D3來補充鈣元素。
鐵劑
如果存在缺鐵的現象，可能會引起貧血的情況發生，因此在進行血液透析期間應定期給予靜脈補鐵治療，以改善因慢性腎臟病失代償期所引起的缺鐵現象。
4.Beta2感受器激動劑：對於肺部功能不全的患者，還可選擇沙丁胺醇(Salbutamol)或撲咳喘(Bricanyl)等藥物進行吸入或口服治療，以改善通氣狀況。
針對症狀的藥物
抗感染類
由於血液透析患者免疫力下降，易併發各種感染性疾病，常見於呼吸道感染，若合併有細菌感染的情況下，則需根據致病菌型別選擇敏感抗生素進行治療，如頭孢呋辛酯(Cefuroxime Axetil)、阿莫西林（Amoxicillin）等。
2.非類固醇抗發炎藥（NSAID）：如希樂葆(Celecoxib)、雙氯芬酸鈉(Diclofenac sodium)等，可用於緩解疼痛不適的症狀。
降壓藥
由於血液透析會降低身體內的血壓水平，故建議遵醫囑聯合硝苯地平(Nifedipine)、纈沙坦(Valsartan)分散片等降壓藥物控制血壓。
利尿藥
如氫氯噻嗪(Hydrochlorothiazide)、螺內酯(Spironolactone)等，用於治療心臟衰竭、高血壓、水腫等情況。
除上述常見的幾種藥物外，還需注意部分疾病因素也會干擾到正常的藥物治療，比如糖尿病，當血糖升高明顯時，還應及時服用二甲雙胍(Metformin)片、格列苯脲(Glibenclamide)片等藥物進行治療。
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