尿毒症患者進行血液透析治療的併發症較多，常見的有出血、感染、離線反應、低血壓或高血壓、代謝性酸中毒、高鉀血症等。另外，還可能出現營養不良、心腦血管疾病以及呼吸系統受累等情況。
常見併發症
出血
由於在血液透析過程中需要使用抗凝藥物防止形成血栓，如低分子肝素鈉(Heparin Sodium)、普通肝素鈉(Heparin Sodium)、阿斯匹靈（Aspirin）等，在應用這些抗凝藥物時可能會引起身體出血，表現為皮膚黏膜出血點甚至大出血的情況。
感染
由於長期接受血液透析治療，導致免疫功能低下，且透析液為人工配製液體，細菌易生長繁殖而造成感染，可出現真菌性腹膜炎、肺部感染等症狀。
離線反應
通常是指血液透析結束到體外循環停止的過程中，機器自動給予負壓吸力使患者體內水分及小分子毒素排出體外，當體內的負壓突然消失後會出現一過性的血壓升高和體位不適的現象，部分患者還會伴有噁心、嘔吐的症狀，此即為離線反應。
低血壓或高血壓
若在血液透析前沒有控制好血壓，則容易發生透析超濾過多而導致低血壓情況的發生，若未及時改善則可能誘發高血壓。若在血液透析中因灌流不足或者大量出汗等原因，會導致失水大於內環境丟失量，從而引發透析超濾過多現象，此時也會出現輕度的低血壓狀態。若在血液透析結束後不注意補充容量，可能導致血壓下降明顯，甚至休克。
代謝性酸中毒
主要是因為體內多餘的碳酸氫鹽被清除所引起的症狀，常表現為食慾減退、嗜睡、頭暈眼花、頭痛、乏力、噁心、嘔吐等。
高鉀血症
若在血液透析期間留置時間較長，且飲水較少，加上殘餘腎功能較差，則容易出現高鉀血症的表現，如四肢肌無力、腱反射減弱或消失、心律紊亂等。
其他併發症
包括營養不良、心腦血管疾病以及呼吸系統受累等情況，其中營養不良主要與長期不能經口攝入足夠的蛋白質有關，而心血管疾病與動脈硬化等因素相關，呼吸系統受累則可表現為咳嗽、咳痰、氣短等表現。
少見併發症
尿毒症患者合併腫瘤的機率較高，常見的有胃癌、結直腸癌、非霍奇金淋巴瘤等，此外還有可能發生甲狀腺髓樣癌。一般而言，隨著病情進展，上述併發症發生的機率也逐漸增加，因此建議尿毒症患者應定期複診，並遵醫囑根據自身情況選擇合適的飲食方案。
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