臨床上對於尿毒症患者的用藥並沒有特殊要求，一般建議在醫生指導下根據病情選擇合適的藥物進行治療即可。常用的口服藥物有抗生素、利尿劑、鈣通道阻滯劑等；也可以使用透析療法和腎臟移植來進行治療。
口服藥物
抗生素
如希復欣敏(Cefixime)分散片、阿莫西林（Amoxicillin）等，可以起到抗菌消炎的作用，在一定程度上能夠延緩疾病的進展。
利尿劑
常見的包括呋塞米(Furosemide)、氫氯噻嗪(Hydrochlorothiazide)等，透過抑制身體內的水電解質平衡來達到利尿的效果，從而減輕水腫的情況發生。
鈣通道阻滯劑
比如硝苯地平(Nifedipine)、非洛地平(Felodipine)等，主要作用於身體的血管緊張素轉換酶，從而擴張周邊動脈而降低血壓，可有效預防心腦血管併發症的發生。
其他
如果存在貧血症狀，還可遵醫囑服用葉酸或亞甲藍注射液等藥物進行改善。若伴有高鉀血症，則需及時應用碳酸氫鈉(Sodium bicarbonate)改善電解質紊亂情況。
透析療法
尿毒症是急慢性腎衰竭的終末階段，此時殘存的腎單位較少或者沒有功能，因此需要藉助機器幫助排洩體內的廢物以及水分，常用的方法為血液透析與腹膜透析兩種。其中血液透析主要是利用半滲透膜兩側物質濃度不同，使水及小分子物質從低滲一側向高滲一側移動的現象，以達到清除體內代謝產物、維持水電解質平衡、改善酸鹼失衡的目的。而腹膜透析是指利用病人的腹腔作為天然的透析囊，將含有適當成分的透析液灌入到患者的腹膜中，並讓腹透液在腹腔內流動，從而達到排出毒素的目的。
腎臟移植
該方法屬於一種替代性的治療方法，即把一個健康的腎臟捐獻給尿毒症患者，使其重新獲得正常的腎功能，但術後可能會出現排斥反應，應密切觀察並積極處理。
其它方式
此外，也可採取血液濾過的方式對身體進行排毒，即將一根導管經股靜脈插至左股靜脈，然後連線在配有血液濾過的裝置上，能有效地去除多餘的水分和溶解在水中的一些小分子物質，例如肌酐、尿素氮等，有助於控制病情發展。
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