新生兒黃疸可以分為生理性黃疸和病理性黃疸。如果是生理性黃疸，一般不需要特殊治療，如果屬於病理性黃疸，則需要在醫生指導下進行藥物、光照等綜合治療。
生理性黃疸
茵梔黃口服液
主要成分為金銀花提取物、紅景天、大黃、梔子浸膏等成分，具有清熱解毒、利溼退黃的功效，常用於治療肝膽溼熱所致的黃疸，症見身黃、目黃、尿黃等。服用此藥物時，建議空腹用溫開水送服，這樣效果會更好一些。
2.：由短乳酸杆菌、長雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌三重活菌組成，可直接補充腸道益生菌，抑制致病菌生長繁殖，維持正常腸道功能，促進胃腸道消化吸收，可用於治療腹瀉、便秘、腹脹等消化道異常症狀，也可用於治療新生兒黃疸引起的不適症狀。
葡萄糖水
由於新生兒剛出生不久，胃腸功能尚未發育完善，所以家長可以在餵奶之前給新生兒喝點葡萄糖水或者白開水，能夠有效預防低血糖的情況發生，並且也能夠防止電解質紊亂的發生。
其他食物或飲品
如橙汁、小米粥、麵湯等流食或半流食，都可在一定程度上輔助緩解新生兒黃疸的症狀。
病理性的黃疸
藍光照射療法
是目前臨床中治療黃疸的主要方法之一，主要是利用波長為425-475mm的連續光源，透過將患兒全身裹住後置於光線充足處進行照射的方法來達到治療的效果。
藥物治療
對於血型不合引起溶血性黃疸的新生兒，在排除終止妊娠後，可以透過靜脈注射丙種球蛋白、輸血法等方式來進行處理，必要時也可以遵醫囑使用氫化可的松、地塞松(Dexamethasone)等激素類藥物進行治療。
換血療法
當出現高未結合膽紅素血症時，應及時給予光療並酌情考慮換血療法，以降低膽紅素水平，減輕膽紅素對各器官的損害。
需要注意的是，具體的用藥應在專業醫師指導下行選擇規範應用，不可盲目自行用藥，以免造成不良後果。另外，如果採取以上措施後，黃疸仍然沒有消退，應立即前往醫院就診，查明原因並對因治療。
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