如果懷疑新生兒發生溶血病或敗血症等疾病時，需要進行相關輔助檢查明確診斷。其中腦脊液檢查是針對神經系統方面的輔助檢查之一，而並非針對黃疸的特異性檢查，因此不建議家長盲目為新生兒做此項檢查。當出現高膽紅素血症導致的黃疸，以及非高膽紅素血症導致的黃疸兩種情況時，處理方式也有所不同。
高膽紅素血症所致黃疸
阻塞因素
如先天性膽總管囊腫、先天性肝內膽管閉鎖、先天性巨結腸、先天性腎上腺皮質功能減低症、食道閉鎖、十二指腸閉鎖、環狀胰臟等，這些疾病可引起膽汁排洩障礙，進而影響到體內膽紅素代謝，從而誘發黃疸的情況。
間接膽紅素升高
如遺傳性間接膽紅素升高，包括Gilbert症候群和Dubin-Johnson症候群，直接膽紅素升高的原因主要包括先天性高膽紅素血症、母乳性黃疸、藥物性黃疸、病毒性肝炎等。
肝細胞傷害
常見於病毒感染引起的肝細胞受損，如巨細胞病毒感染、EB病毒感染、弓形蟲感染等，均可造成肝細胞傷害，使肝臟對膽紅素的攝取結合能力下降，繼而導致非結合膽紅素在血液中濃度增加，表現為黃疸的症狀。
其他方面
如先天性甲狀腺功能低下、遺傳性果糖耐受缺陷症、半乳糖轉運蛋白基因缺陷症、酪氨酸血尿症等也可導致新生兒出現黃疸的情況。
二、非高膽紅素血症所致黃疸
生理性黃疸
由於新生兒時期，體表面積相對較大，皮膚散熱功能較差，故容易出現體溫調節失常的現象，若未及時增添衣物，則易因寒冷刺激而發生寒顫，致使末梢小血管收縮，引起組織缺氧，大量還原血紅素進入血液循環系統，也會呈現為黃疸的表現。
母乳性黃疸
是指僅由純母乳餵養的新生兒發生的持續性黃疸，一般無臨床症狀且各項實驗室檢查均正常，停止哺乳後黃疸逐漸消退，再次以奶製品混合餵養或多喂水則繼續維持或加重黃疸的程度。
鐵超載型黃疸
是由過多的含鐵血紅素沉積所造成的病理狀態，與過量補鐵有關，其特徵性的表現即為黃疸，同時伴有骨骼肌無力、精神運動發育遲滯等症狀。
臨床上對於新生兒黃疸是否需要透過腦脊液檢查來確診，還需要根據實際情況判斷，並不能單純地認為該檢查用於確診新生兒黃疸。另外，在日常生活中應加強對新生兒的看護，注意保暖，保持區域性清潔衛生，避免接觸有毒有害物質。
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