新生兒出現黃疸後如果應用藥物治療無效時，可以進行藍光照射、換血療法等物理方法治療。如果是母乳性黃疸導致的，則應停止哺乳改為奶粉餵養，並注意補充維生素。
物理方法治療
藍光照射
若經檢查發現是生理性黃疸所致，且膽紅素水平不高，一般不用特殊處理，可自行消退。但如果膽紅素水平較高則需及時採取措施，如進行藍光照射，透過高亮強紫外線使體內的膽紅素轉化為無害物質並排出體外。
換血療法
對於溶血引起的黃疸，病情較重者需要採用換血療法來改善症狀，即將患兒血液中的大量致敏紅血球或大量的抗體蛋白置換為相同血型的他人血液。
按摩與熱敷
家長可以透過給新生兒做被動運動的方法促進肝臟血液循環，加速體內膽紅素代謝，從而達到退黃疸的目的。另外也可在醫生指導下對新生兒腹部進行順時針方向的按揉和熱敷，以刺激腸道蠕動，促使糞便排出，有助於黃疸排洩。
其他方式
部分新生兒黃疸可能是因為胎便堆積而導致，此時可透過使用甘油球通便排氣，進而緩解黃疸的症狀。
飲食調理
由於新生兒剛出生不久，胃腸道功能尚未發育完善，因此建議將配方奶量減少50ml左右，同時增加餵奶次數，每天保證6-8次，每次餵奶完畢後豎抱拍背至打出奶嗝為止，以促進食物消化，避免腹脹引起腸絞痛而加重黃疸。
藥物治療
當新生兒存在感染因素時，可在醫生指導下服用抗生素類藥物控制發炎反應，如阿莫西林（Amoxicillin）、希復欣敏(Cefixime)顆粒等。此外還可遵醫囑口服茵梔黃顆粒、熊去氧熊膽酸(Ursodeoxycholic Acid)等藥物，具有利膽退黃的作用，幫助黃疸消退。
手術治療
若由膽道畸形、膽囊腫大等原因所導致的梗阻性黃疸，必要時還應及時進行手術矯正，以免影響正常成長發育。
日常生活中應注意加強對新生兒的看護，尤其是眼睛以及臍部周圍皮膚的護理。同時還應注意觀察有無發燒、嗜睡等症狀，一旦發生異常情況應及時就醫診治。
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