引起新生兒出現黃疸的原因較多，可分為生理性因素和病理性因素。若新生兒的頭部黃疸僅輕微升高，且無其他不適症狀時，則為生理性黃疸所致，無需特殊處理；但如果黃疸指數明顯增高，並伴有發燒、嗜睡等異常表現時，則考慮與母乳性黃疸、病毒性肝炎、敗血症或化膿性腦膜炎有關。
生理性因素
由於新生兒肝臟功能發育不完善，體內膽紅素代謝能力較差，導致血液中膽紅素濃度較高，進而表現為頭面部皮膚發黃的症狀。此種情況屬於生理現象，一般不用做特殊的治療，可自行消退。
病理性因素
母乳性黃疸
通常是因為母親進食了大量含有胡蘿蔔素的食物所造成，如柳丁、橘子等，還有部分母親存在乳腺管阻塞的情況，也會導致寶寶攝入母乳後發生暫時性的非溶血性黃疸。此時建議產婦停止餵養母乳2-3天，待黃疸數值恢復正常後再進行哺乳。
病毒性肝炎
當新生兒受到病毒感染時，會導致肝細胞受損，從而影響到體內的膽紅素代謝，使多餘的膽紅素沉積在身體各部位，包括頭部。對此應遵醫囑使用阿德福韋(Adefovir)顆粒、重組人干擾素(Interferons)α2b注射液等藥物進行抗病毒治療。
敗血症或化膿性腦膜炎
如果新生兒患有以上疾病，會使細菌產生的毒素進入血液循環並蔓延至全身，從而誘發高燒、痙攣以及黃疸等症狀。患者需要及時就醫，在醫生指導下服用左氧氟沙星(Levofloxacin)、鉀鹽青黴素V等抗生素類藥物進行抗感染治療。
其他
還可能與遺傳性疾病、先天性膽道閉鎖等因素有關，需進一步去醫院做詳細的檢查來明確診斷。
對於因母乳問題引起的黃疸，可以透過奶粉餵養等方式幫助排洩出多餘膽紅素。如果是病毒性肝炎引起的黃疸，可在醫生的指導下口服雷巴威林(Ribavirin)顆粒、恩替卡韋(Entecavir)等抗病毒藥物來進行治療。
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