引起新生兒黃疸的原因較多，可分為生理性原因和病理性原因。如果出現新生兒黃疸偏高的情況，建議家長及時帶新生兒到醫院就診，由醫生進行判斷，並根據不同的病因予以相應的治療。
生理性原因
生理因素
由於早產兒的肝臟功能發育不成熟，導致肝細胞攝取和結合膽紅素的能力差，腸蠕動遲緩，對腸腔內大便中的膽色素吸收不良，均會導致血清中非結合膽紅素升高而發生黃疸。另外，母乳中含有豐富的蛋白質，能與膽紅素競爭腸道上皮細胞感受器，使非結合膽紅素不能被吸收入血液而導致其數值偏高。
光照療法
正常足月新生兒在出生後2-3天出現黃疸，4-5天到達高峰，5-7天消退，早產兒持續較久，足月兒一般在生後24小時內開始出現黃疸，2-3天達高峰，5-6天消退，最長可延長至四周。
病理性原因
敗血症
是指致病菌進入血液循環並在其中生長繁殖、產生毒素而引起的嚴重感染性疾病，常表現為發燒、寒顫、皮膚黏膜瘀點或瘀斑等症狀，此時也可因膽紅素代謝異常而導致新生兒黃疸偏高。
化膿性腦膜炎
是由各種細菌所致的一種常見於嚴重的急性呼吸道或消化道感染之後發生的顱內發炎，臨床表現以發燒、頭痛、嘔吐、煩躁不安等為主，部分患兒會出現抽搐症狀，還可伴有黃疸的情況，主要是因為膽紅素代謝障礙所導致。
先天性甲狀腺功能低下
是甲狀腺功能減低伴體格發育落後症候群的俗稱，主要原因是甲狀腺素合成不足或缺乏，致使身體對於甲狀腺素的反應性下降，從而導致身體代謝降低，若未及時治療，則會影響體內多種器官組織的功能，甚至會造成運動及智力發育障礙，還會伴隨神經系統損害以及骨骼系統傷害等情況，因此也會有上述表現。
其他疾病
如膽道閉鎖、遺傳代謝性疾病、白血病、再生不良性貧血、膽汁淤積性黃疸、溶血性黃疸等均可導致此類情況。
針對不同原因造成的新生兒黃疸偏高，治療方法也有所不同。如果是母乳性的黃疸，可以停止餵養寶寶一段時間再觀察。若是溶血性黃疸則需要遵醫囑使用氫氧化鋁(Aluminium)、普賴鬆(Prednisone)等藥物治療。
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