新生兒出現黃疸時，在醫生指導下使用藥物治療比較好。引起新生兒黃疸的原因較多，如生理性黃疸、母乳性黃疸等一般不需要特殊處理；病理性因素引起的黃疸，需要根據不同的原因進行針對性用藥。
生理性黃疸
茵梔黃口服液
主要成分為金銀花提取物、板藍根提取物、大黃粉、梔子浸膏等，具有清熱解毒、利溼退黃的功效，適用於膽紅素血症所造成的皮膚和黏膜發黃，以及肝功異常者排洩障礙所致的面色發黃等症狀。
新複合離胺酸顆粒
主要成分有鹽酸賴氨酸(Lysine hydrochloride)、枸櫞酸鉀、碳酸氫鈉(Sodium bicarbonate)等，可以促進成長發育，增強免疫力，用於預防和治療小兒氨基酸代謝紊亂導致的疾病，也可用於高膽寧藍中毒的解毒治療。
3.：屬於微生態製劑類非處方藥藥物，由活菌凍幹粉、乾燥乳酸、乾燥酪酸四水化合物組成，可改善消化不良、腸內異常發酵引發的腹脹、腹瀉等症狀。
益生菌
如果新生兒存在便秘、拉綠便等情況，也可以遵醫囑吃雙歧杆菌三聯活菌散、地衣芽孢桿菌活菌膠囊等調節腸道菌群。
其他
還可以在醫生指導下給新生兒服用葡萄糖水或白開水，以加速體內膽紅素的排出，從而緩解黃疸的症狀。
母乳性黃疸
對於母乳餵養的新生兒，若停止哺乳後黃疸明顯消退，則考慮是由於母乳中的某些物質導致的黃疸，此時需暫停哺乳，待黃疸症狀好轉後再繼續哺乳。
病理性因素
敗血症
是由細菌入血並在其中大量繁殖產生毒素而引起的全身嚴重感染，臨床可見發燒、蒼白、精神萎靡、黃疸、肝脾腫大及化膿灶等表現。可以在醫生指導下應用優合西林注射劑(Ampicillin+Sulbactam)、注射用西他利汀(Ceftazidime)等抗生素控制發炎反應，減輕黃疸的情況。
溶血性黃疸
主要是母嬰血型不合引起的同族免疫性溶血，表現為突然或漸進發生的貧血、黃疸伴肝脾腫大，早期血液檢查顯示網織紅血球增多，伴有核左移，尿膽原增加。可在醫生指導下及時輸注洗滌紅血球，必要時採用換血療法，同時配合光療，降低血中未結合膽紅素水平。
除了以上情況以外，急性淋巴細胞性白血病也可能會導致這種情況的發生，建議家長及時帶新生兒前往醫院就診，明確病因後積極對因治療。
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