導致新生兒睡覺不踏實的原因較多，如外界因素、餵養不當等非病理性原因，以及消化不良、感冒、腦損傷症候群或顱內出血、腸痙攣、缺鈣等病理性原因。而黃疸是由於膽紅素代謝障礙所引起的血清膽紅素升高，因此新生兒出現黃疸時有可能會導致睡覺不踏實的情況發生。
與黃疸有關
當新生兒存在比較嚴重的黃疸時，可能會引起神經系統異常，此時可表現為精神萎靡、嗜睡、抽搐等症狀，從而影響到睡眠狀態，造成睡覺不踏實的表現。建議家長及時帶新生兒進行檢查明確診斷，並遵醫囑使用藥物治療，比如口服茵梔黃顆粒或者靜點藍光針劑等。
與黃疸無關
外界因素
可能是由於環境溫度較低等因素刺激而導致的睡覺不踏實，應適當增加衣物並調整室內溫度至25℃左右，保證新生兒處於較為舒適的環境中即可逐漸緩解。
餵養不當
通常是由於進食較少或者是過量進食，導致胃腸道功能紊亂，繼而出現腹脹、腹瀉等情況，也可使新生兒因腹部不適而不易入睡。對此應及時改善上述情況，症狀較輕者可透過按摩的方式促進排氣，嚴重者需在專業醫生指導下應用甘油球通便，以改善病情。
消化不良
通常是由腹部著涼、飲食結構不合理等原因所致，會造成胃腸蠕動減慢，食物不能及時被身體吸收，在腸道中發酵產生氣體，進而引發腹痛、噁心、嘔吐、哭鬧不止等表現，也會導致新生兒無法入眠。一般可以給新生兒做腹部熱敷和按摩來緩解，如果效果不佳，則需要遵照醫囑服用雙歧杆菌三聯活菌散等益生菌製劑進行調理。
感冒
若新生兒未做好保暖措施，受到寒風刺激後容易誘發感冒，不僅會出現鼻塞、流涕的症狀，還會因為呼吸不暢而表現出煩躁不安、哭鬧不止的情況，此時則會影響正常睡眠。針對這種情況，可以在醫生指導下給予小兒氨酚黃那敏顆粒、板藍根顆粒等抗感冒藥治療。
5.腦損傷症候群或顱內出血：這兩種疾病都會對新生兒的大腦發育造成嚴重影響，使其出現頻繁痙攣發作的現象，同時還會伴有明顯的嗜睡、反應低下等現象，所以會經常夜間醒來。對於該類疾病的治療，主要採取綜合康復訓練的方法恢復其運動功能及生活自理能力。
缺鈣
是指體內的鈣質水平低於正常值，常見於隨著年齡增長體內鈣消耗較大但補充不足的情況，或是維生素D缺乏的情況下也會影響到鈣元素的吸收利用，進而出現肌肉乏力、生長緩慢、愛出汗、睡覺不踏實等臨床症狀。對此可在醫生指導下給予葡萄糖酸鈣、碳酸鈣片等補鈣製劑治療。
除以上相對常見的病因外，還可能存在其他的可能性疾病，比如癲癇等。若新生兒長期存在睡覺不踏實的情況，且排除外界因素的影響，則考慮為疾病因素所致，需要積極前往醫院的小兒科就診，完善視診、血常規等檢查查明具體原因。
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